離子色譜柱一般比常規(guī)液相色譜分析柱價格要貴很多，但如果正常使用，離子色譜柱也可以有很長的使用壽命，因此對離子色譜的維護和清洗十分重要。一般而言，沒有統(tǒng)一維護和清洗步驟，不同類型不同商家的離子色譜在說明書均有十分詳細的說明，用戶在使用前一定要注意仔細閱讀。
　　1.離子色譜柱的維護，其原則如下：
　　a.確保離子色譜柱不干燥;
　　b.確保離子色譜柱不長霉;
　　c.確保離子色譜柱不進入顆粒物;
　　d.確保離子色譜柱不進入不可逆吸附物，特別是有機污染物;
　　e.確保離子色譜在一定的流速、壓力條件運行;
　　2.離子色譜柱常見的問題如下：
　　a.柱壓升高，檢查流路沒有阻塞的前提下，更換色譜柱過濾網(wǎng)板，一般情況下更換保護柱進口端的網(wǎng)板。
　　b.分離度降低，可以是由于色譜柱的柱效降低或選擇改變所引起的，可以通過適合的清洗對離子色譜柱進行清洗，或者改變離子色譜的流動相來改善分離。
　　c.死體積增大，由于分離柱入口樹脂壓力使樹脂造成空隙或者樹脂壓碎而成，使離子色譜分離度下降、分叉等，這時可以填充相同類型的樹脂和惰球樹脂球以減少死體積。
　　而對于受污染的離子色譜柱，一般要進行清洗，清洗前一定要將色譜柱與抑制器斷開，保護柱和分離柱分開清洗，或者將保護柱接在分離柱之后進行清洗。
　　3.清洗的原則是：
　　a.用高濃度的淋洗液清洗強保留的污染物;
　　b.用有機酸如草酸、酒石酸、檸檬酸等清洗金屬污染物;
　　c.用有機溶劑兼容的大濃度清洗有機污染物;
　　d.清洗之后，必須用二次去離子水平衡，再用淋洗液平衡。
　　雖然對有機溶劑兼容的離子色譜柱，受污染后都可以用清洗后再生，但并不是所有的污染物都能夠通過清洗去除的，正確使用離子色譜柱和采用合適的樣品預(yù)處理手段是延長離子色譜柱壽命的好方法。